リチャード（トーマス・ミドルディッチ）がCEO職から突然追われ、一ランク下のCTO職をオファーされた所から始まるシーズン3。今シーズン注目したいのは、アーリック（T.J.ミラー）、ジャレッド（ザック・ウッズ）、ディネッシュ（クメイル・ナンジアニ）、ギルフォイル（マーティン・スター）などのチームメンバーがどこまで忠誠を尽くすかということ。オフィスから事業目的まで、パイドパイパーの全てを総取っ替えしようとする新CEOの元で、メンバーたちは芸術vs.商業の戦争に打ち勝つ方法を模索しなければならない。その頃ギャビン・ベルソン（マット・ロス）は、自分の起こした大失敗のせいで地に落ちたフーリー（Hooli）のイメージ回復を図り、ビッグヘッド（ジョシュ・ブレナー）は新しいパートナーシップを締結する。