In der dritten Staffel kämpft Bumpy Johnson weiterhin mit anderen Thronanwärtern – genauer gesagt, der kubanischen Mafia aus dem benachbarten Spanish Harlem – um die Kontrolle über Harlem. Durch die Konfrontation mit der kubanischen Mafia geraten Bumpy, seine Angehörigen und seine Gemeinschaft nicht nur ins Fadenkreuz der rivalisierenden Italiener, sondern werden auch zur Zielscheibe rücksichtsloser lateinamerikanischer Attentäter und letztendlich auch der CIA. „Godfather of Harlem“ schildert die Kollision der kriminellen Unterwelt mit der Bürgerrechtsbewegung während einer turbulenten Zeit in der amerikanischen Geschichte.