Situada en un reino montañoso mítico, la película sigue las desventuras de un arrogante y egocéntrico joven emperador llamado Kuzco, a quien su asesora – la malvada y ávida de poder diva Izma – transforma en una llama. Abandonado en la jungla, la única oportunidad de Kuzco de regresar a su hogar está en manos de un bondadoso campesino llamado Pacha. El mundo perfecto de Kuzco se convierte en un perfecto desastre cuando este extraño dúo se ve empujado a enfrentarse a espeluznantes peligros, apuros salvajamente cómicos y – lo más terrible de todo – el uno al otro, mientras luchan por devolverle a Kuzco su trono antes de que Izma (ayudada por su musculoso sirviente Kronk) logre detenerlos y acabar con ellos. Al final, la buena amistad de Kuzco y Pacha le enseña al monarca a ver su mundo de manera diferente.