En G.I. JOE: EL CONTRAATAQUE, el equipo no sólo debe combatir a su mortal enemigo COBRA; también se ve obligado a pelear contra amenazas provenientes del interior del gobierno que ponen en peligro su propia existencia. Al convertir la película a 3D se eleva a un nivel completamente nuevo y lleva a los espectadores incluso más cerca de la incesante acción.