Balto on puoliksi siperianpystykorva ja puoliksi susi, eikä hän tiedä, minne hän todella kuuluisi. Todellisia ystäviä lukuun ottamatta alaskan asukkaat ovat hyljänneet hänet. Eräänä päivänä Nomen kylässä esiintyy kurkkumätää ja epidemia tarttuu nopeasti lapsiin. Kun raivokas lumimyrsky estää kaiken liikenteen, sairaille ei mitenkään saada pelastavaa lääkettä…ellei rekikoirien joukko lähde tuhannen kilometrin taipalelle sokaisevaan arktiseen myrskyyn hakemaan parannuskeinoa. Vain Balron voi pelastaa rekikoirat ja lapset. Balto perustuu uskomattomaan tositarinaan legendaarisesta sankarista, joka voitti puolellen kokanaisen kansakunnan.