Scarlett Johansson tähdittää visuaalisesti näyttävää Ghost in the Shell, toiminnantäyteistä seikkailua, joka sijoittuu tulevaisuuden maailmaan, jossa ihmisiä on paranneltu teknologialla. Uskoen pelastuneensa kuolemalta Majorista (Johansson) tulee ensimmäinen laatuaan: ihmismieli keinotekoisen kehon sisällä, joka on suunniteltu taistelemaan sodassa kyberrikollisuutta vastaan. Tutkiessaan vaarallista rikollista Major tekee järkyttävän löydön – yhtiö, joka hänet loi, valehteli hänen menneisyydestään kontrolloidakseen häntä. Epävarmana siitä, mitä uskoa, mikään ei pysäytä Majoria selvittämästä hänen todellisen henkilöllisyytensä mysteeriä ja etsimästä kostoa yhtiölle, jota hänet rakennettiin palvelemaan.