Lähes katatonisessa tilassa oleva nuori mies on suljettu mielisairaalaan. Yhteisretken aikana mies tapaa naisen menneisyydestään, ja hän herää eloon saadessaan muistutuksen lapsuutensa traumasta. Järkytys saa miehen karkaamaan sairaalasta ja etsimään kulttia johtavaa äitiään. Santa sangre on elokuva siitä, miten hulluus leviää avoimeen yhteiskuntaan, ja jonkin ymmärrettävän etsimisestä maailmassa, jota ei voi selittää - kuvattuna Alejandro Jodorowskyn ikonisen surrealismin keinoin.