Mille ans après qu'un cataclysme ait forcé les humains à fuir la Terre, Nova Prime est devenue la nouvelle maison de l’humanité. Le général légendaire Cypher Raige retourne auprès de sa famille après une longue période de service, prêt à être un père pour son fils de 13 ans, Kitai. Lorsqu'une pluie d'astéroïdes endommage le vaisseau de Cypher et Kitai, ils font un atterrissage forcé sur une Terre désormais inconnue et dangereuse. Son père mourant gisant dans le cockpit, Kitai doit entamer une longue marche en terrain hostile pour récupérer leur balise de détresse. Toute sa vie Kitai a voulu être un soldat comme son père. Aujourd'hui il tient sa chance.