Captain America: Le Soldat de l'Hiver reprend là où Avengers s'était arrêté. Après les événements cataclysmiques survenus à New York, on retrouve le héros de Marvel Steve Rogers, alias Captain America, menant une vie tranquille à Washington où il tente de s'adapter au monde moderne. Lorsqu'un collègue du S.H.I.E.L.D. est attaqué, Steve est impliqué dans un réseau d'intrigues qui met le monde en péril. En s'associant à la Veuve noire, Captain America se bat pour déjouer une conspiration toujours plus tentaculaire, alors que des tueurs professionnels tentent de le réduire au silence. Lorsque l'étendue du complot est dévoilée, Captain America et la Veuve noire sollicitent l'aide d'un nouvel allié, Le Faucon. Ils se retrouvent rapidement face à un ennemi puissant et insoupçonné: le Soldat de l'Hiver.