Jacques Kristoff, agent secret, est chargé d'escorter une voleuse, Galina Konstantin, de Slovaquie jusqu'en Allemagne à bord du train n°681, le Bratislava-Munich. Celle-ci est en possession d'une mallette renfermant une souche mutante de la variole qu'elle vient de dérober au parti réactionnaire slovaque. Une véritable bombe bactériologique, aux effets dévastateurs, convoitée par un redoutable groupe terroriste qui investit le train et prend les passagers en otages...