L'armonia del Pianeta è minacciata dall'Alleanza dei Malvagi: il Signor S., Perfidia, Viperiana e Serpe hanno convinto il mondo intero che Sofì e Luì sono terribili criminali e solo loro, i Malvagi, sono i buoni che possono salvare l’umanità dalla cattiveria dei Me Contro Te. Il Signor S. ha perfino dato vita a una nuova creatura che unisce i poteri malefici di Perfidia, Viperiana e Serpe: Perfidiana. Nonostante l'aiuto di Pongo, Chicco, Tara, Ajar e Ombra, Sofì e Luì non riescono a contrastare la forza distruttrice dei Malvagi. Ma non tutto è perduto e per i Me Contro Te e i loro amici c’è solo un modo per riportare l’armonia nel mondo: tornare indietro nel tempo e scoprire perchè il Signor S. è diventato il cattivo che è oggi.