“マシン”のおかげで、ニューヨーク市警のジョス・カーター刑事(タラジ・Ｐ・ヘンソン)、ライオネル・ファスコ刑事(ケヴィン・チャップマン)とともに数々の犯罪を未然に防いできた彼らは今、“不確かな未来”に直面し、マシンの驚異的な進化を目の当たりにする。リースとフィンチは、マシンが唯一意志を伝達しているルート(エイミー・アッカー)、新メンバーのサム・ショウ(サラ・シャヒ)とともに、進化し続けるマシンに導かれていく。