Als Gotham City geteisterd wordt door een reeks bizarre misdaden, gepleegd door de Animilitia, een beestachtige groep schurken (bestaande uit Silverback, Cheetah, Killer Croc en Man-Bat), schiet Batman in actie en gaat hij op onderzoek uit. Maar zou de Animilita wellicht werken voor de machtige zakenman Oswald Cobblepot, oftewel, The Penguin? Uiteindelijk moeten Batman, Green Arrow, Flash, Nightwing en Red Robin hun krachten samenbundelen en het opnemen tegen Cobblepots nieuwe uitvinding van robotachtige cyberbeesten in "Animal Instincts".