De Wolverine keert terug en gaat de strijd aan met zijn aartsvijand in een actievolle strijd om leven of dood die plaatsvindt in het moderne Japan. Logan is voor het eerst kwetsbaar en gaat tot zijn fysieke en emotionele grens. Hij confronteert niet alleen dodelijk Samoerai zwaarden, maar ook zijn innerlijke strijd tegen zijn eigen sterfelijkheid, een episch gevecht dat hem voor altijd zal veranderen.