Alice har tillbringat de senaste åren med att följa i sin fars fotspår och seglat på världshaven. När hon kommer hem till London, hittar hon en magisk spegel och återvänder till Underlandet och sina vänner. Där upptäcker hon att den galne Hattmakaren har mist sin Myckenhet. Vita drottningen skickar henne att låna Kronosfären, ett metallklot som finns i Det stora uret som styr all tid. Hon reser tillbaka i tiden och inleder en riskfylld kapplöpning mot klockan för att rädda Hattmakaren.