Denna hisnande resa tar sin början när den unge Sean Anderson (Josh Hutcherson) tar emot en signal från en mystisk ö som inte finns utmärkt på kartan. Det är en plats med märkliga livsformer, dödliga vulkaner och mer än en enastående hemlighet. Oförmögen att hindra honom från att åka så följer Seans låtsaspappa Hank (Dwayne Johnson) med på resan. Tillsammans med en helikopterpilot (Luis Guzman) och hans dotter (Vanessa Hudgens) ger de sig iväg för att finna ön.