Sechs Monate nach ihren Nahtod-Erfahrungen sind Harlee und Wozniak noch traumatisiert. Doch sie gehen sehr unterschiedlich damit um. Harlee versucht, neu anzufangen -- ohne die moralischen Kompromisse, die sie überall beobachtet. Aber die Qualen, die Stahl (Warren Cole) ihr im Wald zugefügt hat, kann sie nicht vergessen, immer wieder spukt das Bild des skrupellosen FBI-Manns in ihrem Kopf. Wozniak begibt sich unterdessen auf einen Rachefeldzug, sein Antrieb: Er will sein altes Standing zurück und wieder seine Ideen von guter Polizeiarbeit umsetzen. In dieser wegweisenden Phase muss das Team ein nächtliches Massaker aufklären und legt dabei Verbindungen offen, die tief in die eigentlich unantastbare, aber korrupte Geheimdienstabteilung des FBI unter Captain Ramsey (Bruce McGill) reichen. Ramseys Top-Lieutenant Cole (Nick Wechsler) freundet sich mit Harlee an, das ungleiche Paar wird durch einen Loyalitätsschwur auf ihre jeweiligen Mentoren aneinandergebunden. Doch genau dieser Schwur gerät nun in Konflikt mit ihrem Streben nach einer Lösung, die sie moralisch vertreten können. Unterdessen balancieren Wozniak und das Team auf dem schmalen Grat zwischen Gerechtigkeit und der Pflicht, eine gefährliche Fraktion innerhalb des NYPD zu beschützen. Dabei ziehen sie Harlee immer tiefer hinein in die härteste Bewährungsprobe ihres Lebens.