エリザベスの死から2年後。FBIタスクフォースメンバーは解散し、それぞれ別の道を歩いていた。クーパーはエリザベスの娘アグネスの養父となり、レスラーはデトロイトに帰郷、アラムは友人と起業し、パクはFBIの訓練教官、デンベはFBI捜査官になっていた。潜入捜査中、犯人を逃したデンベは大やけどを負い、相棒が射殺される事件が発生する。「巨悪」レディントンを失った世界で悪の暴走が始まっていたのだ。