アークが破滅し、地球に帰還した人類。地上では戦いに負けたクラーク達がマウンテンマンに囚われていた。そこで明らかになるマウントウェザーの謎。恐ろしい秘密。一方残った少年少女たちもまた外の世界で野蛮な種族と戦い続け、アークから帰還したアビー達もまた、地球の脅威に立ち向かっていた。交錯する戦い。そして新たな謎の存在ー光の町。それぞれが、それぞれの世界で、生き残りを懸けた戦いを繰り広げ、熾烈な争いが加速する。仲間を守るためにする苦渋の決断。信頼と裏切り。そして犠牲。共存は不可能 - 最後に勝ち残るのはどの種族か？